Відділ фітосозології
Відділ квітниково-декоративних рослин
Відділ акліматизації плодово-ягідних культур
Відділ лікарських рослин та нових культур
Відділ дендрології
Лабораторія ландшафтного дизайну та озеленення
Лабораторія розмноження рослин та реалізація посадкового матеріалу
Відділ державної охорони природно-заповідного фонду
Сектор еколого-освітньої роботи
Сектор рекреаційного благоустрою
Фінансово-економічний сектор
Господарський відділ